Il Gruppo Hera, a dimostrazione del proprio impegno per il miglioramento continuo della qualità dei servizi erogati, della protezione ambientale e della salute e sicurezza sui luoghi di lavoro, ha avviato nel 2004 un ambizioso progetto di certificazione del proprio sistema di gestione integrato Qualità Sicurezza e Ambiente.
Nello stesso anno ha ottenuto la certificazione ISO 9001, proseguendo nel 2006 con la certificazione ISO 14001.
Nel corso del primo semestre del 2009 si è provveduto al rinnovo di tutte le certificazioni - ISO 14001 e ISO 9001 - per Hera S.p.A. e per le sette Strutture Operative Territoriali, raggiungendo il risultato di continua crescita e miglioramento con l'aggiunta di alcune estensioni.
Nel secondo semestre del 2008 il Sincert (ora divenuto Accredia dall'unione di Sincert e Sinal), in seguito alla richiesta avanzata da Hera tramite un ente terzo di certificazione, ha riconosciuto al Gruppo una particolare e peculiare complessità organizzativa consentendogli di organizzare il percorso di certificazione OHSAS 18001 per porzioni di scopo, in un percorso triennale dal 2008 al 2010 che vedrà la certificazione per tutto il Gruppo in un'ottica di processo.
In coerenza al progetto approvato, Hera S.p.A. e le sette Strutture Operative Territoriali hanno ottenuto a marzo 2009 la certificazione OHSAS 18001 per i processi direzionali, governati dagli Enti Centrali, ed i processi operativi di Igiene Ambientale e teleriscaldamento. A novembre 2009 si sono concluse con esito positivo anche le verifiche da parte di DNV Italia s.r.l. per l'estensione del certificato OHSAS 18001 per i processi produttivi: servizi di laboratorio; progettazione, costruzione, direzione lavori, avviamento e collaudo di grandi impianti di cogenerazione e produzione di energia elettrica; progettazione, costruzione, conduzione e manutenzione di reti ed impianti per la distribuzione di gas naturale ed energia elettrica.
Per il 2010 Hera S.p.A., al mantenimento della certificazione18001 per le porzioni di scopo già certificate, ha previsto l'estensione della certificazione OHSAS 18001 alle attività relative al Servizio Idrico Integrato.
Il Gruppo Hera ha inoltre in corso valutazioni di fattibilità per ulteriori percorsi di certificazione. In particolare per lo standard SA 8000 (sistemi di gestione per la responsabilità sociale). lo standard ISO 16001 (sistemi di gestione dell'energia) e lo standard ISO 27001 (sistemi di gestione della sicurezza delle informazioni)
Le società del Gruppo che hanno una certificazione di qualità ISO 9001 rappresentano il 97% del totale (con riferimento al numero di lavoratori a tempo indeterminato).
Al dicembre 2009, 64 impianti di smaltimento rifiuti hanno ottenuto la certificazione ambientale ISO 14001; il 93% dei rifiuti smaltiti negli impianti del Gruppo è avvenuto in impianti di smaltimento certificati ISO 14001.
Nel 2005 il Gruppo Hera inserisce tra i suoi obiettivi quello di ottenere la certificazione EMAS della Divisione Ambiente (ora Herambiente) attraverso la progressiva registrazione di tutti gli impianti di smaltimento/recupero rifiuti gestiti dalla Divisione stessa.
Il progetto, presentato ed approvato dal Comitato per l'Ecolabel e Ecoaudit, ha ottenuto nello stesso anno il premio European EMAS Awards 2005-Italy ed è stato considerato, in tal senso, uno dei più interessanti progetti sul panorama europeo.
Gli impianti con registrazione EMAS risultano essere complessivamente 33 e ulteriori 4 impianti hanno superato positivamente la verifica dell'ente esterno e sono in attesa della convalida ministeriale. Nel 2009 i rifiuti smaltiti in impianti con registrazione EMAS sono stati pari al 56% dei rifiuti complessivamente trattati negli impianti del Gruppo. Tale percentuale sale al 59% se si considerano anche gli impianti per i quali è in corso l'istruttoria per la registrazione.
Nel settembre 2010 è stata convalidata la Dichiarazione Ambientale ed effettuata la verifica iniziale per la registrazione EMAS del nuovo impianto di cogenerazione di Casalegno a Imola.